中山大学附属第三医院肇庆医院是按照三级甲等综合性医院标准建设的一所集医疗、预防、保健、康复、教学、科研于一体的国内一流的非营利性综合医院。医院设有门诊医技楼、住院楼、行政综合楼、后勤楼、感染楼、高压氧舱。

肇庆医院由中山三院垂直延伸管理，共享中山三院现有60多个专科医疗资源，亦有中山三院各类专家来院长驻开展工作和短期指导工作。此外，两院区之间将建立远程会诊系统，可高效地进行两院区双向转诊、分级诊疗，确保两院区一体化的管理和同质化的诊疗服务。

肇庆医院设计学科门类齐全，专科特色明显，首期设置临床科室、医技科室24个，专科涵盖：胃肠外科、甲乳外科、肝胆胰外科、血管外科、骨科、神经外科、泌尿外科、心胸外科、心血管内科、呼吸内科、消化内科、风湿免疫科、血液内科、肾病内科、内分泌科、神经内科、感染科、妇科、产科、儿科、康复科、ICU、急诊科、麻醉科、检验科、放射科、超声科、内镜中心、病理科、输血科等。

肇庆医院投入试运营后，将坚持公立医院公益性、资产归政府所有，以中山大学、中山大学附属第三医院强大的综合实力和优质的医疗资源为依托，秉承”医德至上，博积精勤”的精神，坚持以卓越的医疗技术为基石，严谨的医学教育培训为保障，创新性科学研究为引擎，依托科学的规范化管理，以院本部“国内一流、国际知名、专科特色明显的强大的现代化智慧医院”中长期目标为引领，以一流的医疗品质服务于粵西地区民众，积极助力湾区粤西北门户城市打造又一医疗高地。