PCR基因变异结果剖析，一文读懂高通量测序染色体检查

遗传学检查通常分为分染色体水平和基因水平的检测。再再次强调临床上绒毛取样，羊水或脐血穿刺实际上都是指获取胎儿样本的手段而非检测方法。获取胎儿样本后根据不同的临床指征会选择相应的检测手段，如染色体培养核型分析，染色体拷贝数检测，基因检测等。目前临床上染色体层面最常用的检测方法就是核型分析和染色体拷贝数（CNV）检测，而基因层面最常用的检测方法有很多，比如高通量测序，Sanger测序，MLPA（多重连接依赖探针扩增），定量PCR等等。

如何找到适合的检测方法？

基因层面的检测方法有很多，都是相爱相生相互补，并不是说全外显子就最全了，每种单基因病都有自己最适合的检测手段。举个例子：杜氏肌营养不良（DMD）目前首选的检测方法是MLPA，而不是全外显子检测。因为70%以上的患儿是因为DMD基因外显子缺失导致的。因此在检测前医生可能需要与检测实验室及或检测机构充分沟通，给出患者及家属最适合的检测方法，而非“最贵”“最全”的。

国内产前基因检测现状

产前基因检测目前几乎只在国内大型医院开展。临床上常见的需要进行产前基因诊断的情况大概有三种：

1、家里有相关单基因遗传病史，比如父母患病或生过患儿，并已经明确致病变异位点，为了避免胎儿再次患病；

2、孕前筛查发现异常：无遗传病史，但孕期或孕前做了某些筛查，比如夫妻双方携带者筛查、耳聋基因筛查或脆X检测等，发现了某些可能导致胎儿患病的位点；

3、孕期影像学发现异常，需要做产前基因检测，比如胎儿四肢短小需要排除FGFR3基因突变（有开展该项基因检测的医院较少）。

如何解读基因检测的报告？

由于基因检测的复杂性以及国内基因检测及咨询水平的地域差异大，准确的解读相应的基因检测报告并不是一件容易的事。但对于广大孕妇来说，有个最简单的看报告的方法，那就是在致病基因位点已经明确的前提下，我们只要看羊水检测报告中的位点是与家里病人的那个点相同还是与正常人相同就可以了：

如果和家里患者一样，携带了一个或两个或更多的致病性的位点，那说明胎儿还是患者；

如果和正常人一样，携带的不致病的位点，那就说明胎儿基本就是正常的。

但这个是最最基本的看结果方法，实际情况可能要复杂的多，因此还是要让大家记住一句话：“基因层面的变异解读及遗传咨询推荐到正规的产前诊断机构找专业的遗传咨询医生。”

病例解读

病例 1

显性遗传病家族史，父母之一为患者，本次妊娠产前羊水检测报告：

该家庭中孕妇本身为软骨发育不良（侏儒症，身材矮小）患者，生育患儿风险为50%，孕妇本身致病基因突变已经明确（最后的报告即为该孕妇的全外显子检测报告），要求通过羊水穿刺检测明确胎儿是否也携带致病基因突变？

孕妇检测结果如下：提示患者孕妇的基因突变表现为：FGFR3基因DNA序列第1138位由G突变成A了。

羊水检测报告如下：

很遗憾，根据羊水检测结果，胎儿仍携带FGFR3基因突变位点，为患儿。

病例 2

隐性遗传病家族史，头胎患儿，本次妊娠产前羊水检测报告：

该家庭曾生育一患儿，基因检测提示XXX基因存在两处杂合突变（c.1856G>A和c.3G>C），家系验证结果显示此双杂合突变分别来自于其父亲（c.3G>C）和母亲（c.1856G>A），为复合杂合突变。现女方怀孕18周，要求羊水穿刺结合基因位点检测确认胎儿是否患病。

第一胎患儿基因检测结果如下：

检测结果提示患儿致病基因来自父母双方

本次妊娠胎儿羊水检测报告：

本次妊娠胎儿基因两个位点均为野生纯合，胎儿不携带致病基因。

上面两个案例都是真实的在临床上遇到的案例，不同的两种结果，一个为患儿，一个非患儿，结果会告知具有资质的产前诊断医师，并通知孕妇及家属，以便进行下一步诊疗。

病例 3

全外显子检测报告：先证者身材矮小，有生育要求，疑似软骨发育不良，孕前行基因检测，结果如下：

我们建议基因检测报告包含“检测结果”、“结果说明”、“再生育风险评估”、“疾病介绍”等内容，使得患者及家属或送检医生直接就可以“看明白”报告，不像读天书，一目了然。